根系既是果树固定、吸收营养和水分的器官，又是有机营养的贮存和合成器官。健壮的根系是盆景果树正常生长结果的基础。
　　在盆栽条件下，由于根系离心生长的习性和靠近盆壁处土壤通气条件优越等原因，根系多沿盆壁和盆底环绕生长，形成根垫和根团。2－3年后，随着根的伸长和根量的加大，根团充满盆内。这种老化的根团，使盆内土壤比例降低，直接影响了对养分的吸收和运输。因此，要及时换盆、修剪根系、更换新的培养上。换盆的年限应视根系和地上部生长情况灵活掌握，一般为2－3年。
　　与大田果树根系分布深而广的状况相比，盆树的根团对外界环境如温度、湿度的变化，土壤通气状况，施肥浓度，有害物质及病虫害等的适应性和抵抗能力大为降低。不良的环境条件和不适当的管理常造成根系损伤、衰弱甚至死亡。当盆树生长衰弱，叶片变暗、变黄，失去光泽，果实发育不良甚至脱落时，应首先检查根系是否受损，并及时采取措施补救。
　　果树根系如满足其需要的条件时，可以周年不停地生长，其生长高峰常与树冠的生长高峰有交替生长的现象，即在每次新梢发生前或新梢速长期以前，有一个根系生长的高峰期。这一时期根系发生的状况与此后出现的新梢生长状况有直接影响。果树根系均有很强的再生能力，切断之后，伤口附近容易生长大量新根。影响根系生长和吸收的因子有以下几个方面。